MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926

Total Repeats: 58897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021840	CTA	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934213
2	NC_021840	GT	3	6	2297	2302	0 %	50 %	50 %	0 %	525934213
3	NC_021840	ATA	2	6	2354	2359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934213
4	NC_021840	ATT	2	6	2401	2406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934213
5	NC_021840	TTA	2	6	2459	2464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934213
6	NC_021840	CAAAT	2	10	2489	2498	60 %	20 %	0 %	20 %	525934213
7	NC_021840	GAT	2	6	2556	2561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934213
8	NC_021840	AAAG	2	8	2579	2586	75 %	0 %	25 %	0 %	525934213
9	NC_021840	TA	3	6	2600	2605	50 %	50 %	0 %	0 %	525934213
10	NC_021840	ATT	2	6	2611	2616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934213
11	NC_021840	GGT	2	6	2668	2673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934213
12	NC_021840	CTG	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934214
13	NC_021840	A	6	6	2960	2965	100 %	0 %	0 %	0 %	525934214
14	NC_021840	A	6	6	3005	3010	100 %	0 %	0 %	0 %	525934214
15	NC_021840	ATT	3	9	3083	3091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934214
16	NC_021840	GCG	2	6	3107	3112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934214
17	NC_021840	GAC	2	6	3139	3144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934214
18	NC_021840	GAATG	2	10	3184	3193	40 %	20 %	40 %	0 %	525934214
19	NC_021840	GTG	2	6	3261	3266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934214
20	NC_021840	GCG	2	6	3287	3292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934214
21	NC_021840	A	6	6	3336	3341	100 %	0 %	0 %	0 %	525934214
22	NC_021840	AGA	2	6	3355	3360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934214
23	NC_021840	AGT	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934214
24	NC_021840	A	6	6	3393	3398	100 %	0 %	0 %	0 %	525934214
25	NC_021840	TAT	2	6	3425	3430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934215
26	NC_021840	TGG	2	6	3431	3436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934215
27	NC_021840	TGCT	2	8	3454	3461	0 %	50 %	25 %	25 %	525934215
28	NC_021840	GCG	2	6	3465	3470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934215
29	NC_021840	TAT	2	6	3488	3493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934215
30	NC_021840	GCT	2	6	3522	3527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934215
31	NC_021840	AAGT	2	8	3529	3536	50 %	25 %	25 %	0 %	525934215
32	NC_021840	ATT	2	6	3546	3551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934215
33	NC_021840	ATG	2	6	3559	3564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934215
34	NC_021840	ATG	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934215
35	NC_021840	AGGAT	2	10	3703	3712	40 %	20 %	40 %	0 %	525934215
36	NC_021840	CTG	2	6	3817	3822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934215
37	NC_021840	ACG	2	6	3847	3852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934215
38	NC_021840	ATG	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934215
39	NC_021840	CAG	2	6	3895	3900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934215
40	NC_021840	TTG	2	6	3906	3911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934215
41	NC_021840	ATA	2	6	4033	4038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934215
42	NC_021840	GAA	2	6	4095	4100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934215
43	NC_021840	GCA	2	6	4259	4264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934215
44	NC_021840	TTG	2	6	4276	4281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934215
45	NC_021840	ATT	2	6	4396	4401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934215
46	NC_021840	A	7	7	4406	4412	100 %	0 %	0 %	0 %	525934215
47	NC_021840	AATC	2	8	4421	4428	50 %	25 %	0 %	25 %	525934215
48	NC_021840	TGCT	2	8	4450	4457	0 %	50 %	25 %	25 %	525934215
49	NC_021840	AGA	2	6	4487	4492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934215
50	NC_021840	AGA	2	6	4655	4660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934216
51	NC_021840	ATG	2	6	4732	4737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934216
52	NC_021840	ATT	2	6	4896	4901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934216
53	NC_021840	CTA	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934216
54	NC_021840	AAC	2	6	5138	5143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934216
55	NC_021840	A	6	6	5260	5265	100 %	0 %	0 %	0 %	525934216
56	NC_021840	GAA	2	6	5283	5288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934216
57	NC_021840	GC	3	6	5370	5375	0 %	0 %	50 %	50 %	525934216
58	NC_021840	ATT	2	6	5460	5465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934216
59	NC_021840	TTAT	2	8	5581	5588	25 %	75 %	0 %	0 %	525934216
60	NC_021840	GGC	2	6	5636	5641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934216
61	NC_021840	ATG	2	6	5644	5649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934216
62	NC_021840	TAG	2	6	5704	5709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934216
63	NC_021840	ATT	2	6	5724	5729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934216
64	NC_021840	GAA	2	6	5745	5750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934216
65	NC_021840	GAA	2	6	5783	5788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934216
66	NC_021840	AGA	2	6	5953	5958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934217
67	NC_021840	GAT	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934217
68	NC_021840	TAA	2	6	6046	6051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934217
69	NC_021840	T	6	6	6069	6074	0 %	100 %	0 %	0 %	525934217
70	NC_021840	AG	3	6	6097	6102	50 %	0 %	50 %	0 %	525934217
71	NC_021840	AAG	2	6	6144	6149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934217
72	NC_021840	ATT	2	6	6155	6160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934217
73	NC_021840	GTT	2	6	6173	6178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934217
74	NC_021840	AGA	2	6	6220	6225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934217
75	NC_021840	TAG	2	6	6249	6254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934217
76	NC_021840	GAT	2	6	6269	6274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934217
77	NC_021840	ATG	2	6	6297	6302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934217
78	NC_021840	TTTA	2	8	6312	6319	25 %	75 %	0 %	0 %	525934217
79	NC_021840	GCT	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934217
80	NC_021840	TAA	2	6	6373	6378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934217
81	NC_021840	ATT	2	6	6391	6396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934217
82	NC_021840	TCG	2	6	6544	6549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934217
83	NC_021840	AGG	2	6	6615	6620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934217
84	NC_021840	AGA	2	6	6729	6734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934218
85	NC_021840	TGAA	2	8	6800	6807	50 %	25 %	25 %	0 %	525934218
86	NC_021840	AGG	2	6	6863	6868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934218
87	NC_021840	GAG	2	6	6955	6960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934219
88	NC_021840	TAT	2	6	7077	7082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934219
89	NC_021840	GT	4	8	7127	7134	0 %	50 %	50 %	0 %	525934219
90	NC_021840	AAT	2	6	7192	7197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934219
91	NC_021840	AAG	2	6	7268	7273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934219
92	NC_021840	ATT	2	6	7313	7318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934219
93	NC_021840	ATA	2	6	7352	7357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934219
94	NC_021840	ATG	2	6	7450	7455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934219
95	NC_021840	CG	3	6	7468	7473	0 %	0 %	50 %	50 %	525934219
96	NC_021840	AGA	2	6	7476	7481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934219
97	NC_021840	ATT	2	6	7483	7488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934219
98	NC_021840	AGG	2	6	7538	7543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934219
99	NC_021840	TTGT	2	8	7638	7645	0 %	75 %	25 %	0 %	525934220
100	NC_021840	ATC	2	6	7851	7856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934220
101	NC_021840	CGG	2	6	7897	7902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934220
102	NC_021840	TTAG	2	8	7997	8004	25 %	50 %	25 %	0 %	525934220
103	NC_021840	TGG	2	6	8059	8064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934220
104	NC_021840	A	6	6	8092	8097	100 %	0 %	0 %	0 %	525934220
105	NC_021840	TG	3	6	8115	8120	0 %	50 %	50 %	0 %	525934220
106	NC_021840	GCAA	2	8	8155	8162	50 %	0 %	25 %	25 %	525934220
107	NC_021840	ATGT	2	8	8183	8190	25 %	50 %	25 %	0 %	525934220
108	NC_021840	GAA	2	6	8252	8257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934220
109	NC_021840	AAC	3	9	8262	8270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934220
110	NC_021840	CTG	2	6	8274	8279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934220
111	NC_021840	TTG	2	6	8309	8314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934220
112	NC_021840	AATT	2	8	8439	8446	50 %	50 %	0 %	0 %	525934220
113	NC_021840	GAT	2	6	8450	8455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934220
114	NC_021840	TG	3	6	8528	8533	0 %	50 %	50 %	0 %	525934220
115	NC_021840	A	6	6	8534	8539	100 %	0 %	0 %	0 %	525934220
116	NC_021840	GAA	2	6	8549	8554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934220
117	NC_021840	TGT	2	6	8590	8595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934220
118	NC_021840	GAT	2	6	8612	8617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934220
119	NC_021840	ATT	2	6	8630	8635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934220
120	NC_021840	CAT	2	6	8636	8641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934220
121	NC_021840	AGT	2	6	8647	8652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934220
122	NC_021840	AGA	2	6	8680	8685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934220
123	NC_021840	AAG	2	6	8739	8744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934220
124	NC_021840	GGAA	2	8	8787	8794	50 %	0 %	50 %	0 %	525934220
125	NC_021840	TGCT	2	8	8796	8803	0 %	50 %	25 %	25 %	525934220
126	NC_021840	CGGA	2	8	8858	8865	25 %	0 %	50 %	25 %	525934220
127	NC_021840	TGT	2	6	8872	8877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934220
128	NC_021840	GCG	2	6	8891	8896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934220
129	NC_021840	GCG	2	6	9005	9010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934220
130	NC_021840	T	6	6	9090	9095	0 %	100 %	0 %	0 %	525934220
131	NC_021840	TGGT	2	8	9228	9235	0 %	50 %	50 %	0 %	525934220
132	NC_021840	TAG	2	6	9237	9242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934220
133	NC_021840	CAA	2	6	9350	9355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934220
134	NC_021840	A	6	6	9401	9406	100 %	0 %	0 %	0 %	525934220
135	NC_021840	CAA	2	6	9410	9415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934220
136	NC_021840	AGC	2	6	9610	9615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934220
137	NC_021840	GTA	2	6	9659	9664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934220
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158	NC_021840	TGAT	2	8	10814	10821	25 %	50 %	25 %	0 %	525934221
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164	NC_021840	ATT	2	6	11005	11010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934221
165	NC_021840	GAA	2	6	11038	11043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934221
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168	NC_021840	A	6	6	11272	11277	100 %	0 %	0 %	0 %	525934222
169	NC_021840	TGG	2	6	11328	11333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934222
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254	NC_021840	AG	3	6	15277	15282	50 %	0 %	50 %	0 %	525934225
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257	NC_021840	ATG	2	6	15429	15434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934225
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261	NC_021840	AAG	2	6	15528	15533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934225
262	NC_021840	GCAC	2	8	15551	15558	25 %	0 %	25 %	50 %	525934225
263	NC_021840	AAT	2	6	15633	15638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934225
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275	NC_021840	AT	3	6	16450	16455	50 %	50 %	0 %	0 %	525934228
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